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稻属最全超级泛基因组图谱问世

来源:江西住房和城乡建设厅 来源 2024-11-26

记者从江西省农业科学院获悉:近日,国际学术期刊《自然·通讯》在线刊发该院颜龙安院士科研团队联合河北大学杜会龙教授科研团队的研究成果——全球首个稻属最全超级泛基因组图谱绘制成功。

该研究组装了稻属13个野生稻种的基因组,并结合已公开的普通野生稻、亚洲栽培稻和非洲栽培稻基因组,构建了包含101723个基因家族的稻属超级泛基因组。其中,稻属共有的核心基因家族仅占9.84%,共鉴定到63881个栽培稻中尚未发现的新基因家族,使可利用的水稻基因扩大了1.7倍。同时,基于高质量的基因组图谱,研究团队首次在基因组水平重构了稻属的进化关系。

该研究首次从基因组变异和等位变异水平解析了野生稻与栽培稻的多样性。结合基因组注释等多种方法在稻属中共鉴定到7048个抗病基因,其中栽培稻有237个抗病基因家族,野生稻有384个基因家族。这揭示了栽培稻的抗病基因倾向于成簇存在,而野生稻则主要以单个形式存在的分布规律。

江西省超级水稻研究发展中心副主任谢红卫表示,该项科研攻关持续了12年,该研究构建的稻属超级泛基因组极大地扩展了水稻遗传改良的基因池,对野生稻种质创新利用具有重要理论意义和应用价值,同时为稻属进化和驯化研究提供新见解。


来源:江西日报
陈旻

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